交通运输工程主要研究交通运输系统规划与管理、交通信息工程及控制、道路与铁道工程、载运工具运用工程相关理论与技术。交通运输工程学科主要关注道路、铁路、航空、水运等各种交通方式的相互协调与竞争关系，分析交通系统如何满足社会经济发展的需求，同时又考虑有限的资源制约，以及对自然生态及人居环境产生的巨大影响。为解决交通运输问题，不仅需要对系统规划、工程建设、运营管理等进行理论研究，还必须有明确的发展战略和高新技术支持。
交通运输工程学科拥有云南省交通运输实验教学示范中心、昆明泛亚交通物流研究院、智能交通系统工程技术研究中心等科研平台。目前已配置多台（套）先进的实验设备（仿真软件）和实验手段，能支持该学科内所有研究方向的科研工作。交通运输工程学科现有教职工57人，其中教授6人、副教授16人。交通运输工程学科培养的硕士主要在政府部门、事业单位、交通运输企业等从事本学科及相近学科的管理、工程设计和运作管理等工作。
研究方向
| 序号 | 研究方向名称 | 主要研究内容、特色和意义 |
| 1 | 道路交通系统仿真与安全 | 研究微观、中观尺度下交通路网、交通流模型及其与交通控制、事件等的相互作用与关系，利用仿真研究面向交通规划、交通工程、交通安全的定量评价分析以及优化方法。 |
| 2 | 现代交通规划技术研究及运用 | 研究交通系统规划理论与方法、交通需求分析与管理、城市道路交通控制、城市交通系统规划与管理、城市公共交通管理理论与方法等。 |
| 3 | 交通组织与信号控制技术 | 主要以交通流理论、优化理论和控制理论等为基础，运用计算机科学与技术、现代通信技术和多媒体技术等研究交通运输系统中的交通控制策略、信号控制方案与优化及效果评价理论和方法，以及各种监视控制系统。 |
| 4 | 道路路基路面工程研究 | 研究道路路基与地基的强度、稳定性、沉降及变形，进行道路路基处治方法、道路软土地基检测、深基坑工程检测、路基工程施工技术等方面的研究。 |
| 5 | 车辆检测与诊断技术 | 跟踪现代汽车技术发展方向，以提高在用汽车可靠性、安全性和排放性为目标，以中高档轿车和高档大客车为重点，应用计算机技术、电子技术和故障诊断理论，开展汽车检测诊断理论、方法和仪器设备的研究和开发。 |
| 6 | 物流系统规划 | 研究现代物流园区规划与设计、供应链管理与库存控制、现代物流配送、现代物流设施设备、企业物流资源整合与物流管理、现代物流技术及应用等。 |
| 7 | 内燃机工作过程 | 基于高原地区的特殊性，建立大气模拟综合测量系统，主要研究在不同海拔地区运行的内燃机动力性、经济性、排放及其燃烧过程之间的差别。 |
| 8 | 新能源汽车运用技术 | 围绕汽车节能、减排的主题，针对纯电动汽车、混合动力、燃料电池、增程式等节能与新能源汽车的发展，在其运用技术方面进行研究。 |